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      STR遺傳標記分析服務

      短串聯重復序列(short tandem repeat, STR),也稱微衛星DNA(microsatellite DNA),是指以少數幾個核苷酸(多數為2-6個)為單位多次串聯重復的DNA序列。由于重復單位及重復次數不同,使其分布具有很大的差異性,構成了STR的遺傳多態性,并按孟德爾規律呈共顯性遺傳。由于STR具有種屬特異性、適合于復合擴增、使其在作物種質鑒定、親緣關系分析、法醫和親子鑒定等領域都得到了廣泛的應用。

      STR 作為遺傳標記有以下優點:

      l 片段短,可以復合擴增,提高識別能力

      l 多態性程度高,等位基因多,鑒別能力強(在每個STR 位點上,多有幾個到幾十個等位片段)

      l 適合于陳舊的樣品,檢測能力強

      l 靈敏度高,有利于微量樣品的檢測

       

      STR檢測的應用:

      1 品種鑒定

      2 系譜分析

      3 法醫及親子鑒定

      4 群體間遺傳距離分析

      5 進化和遺傳多樣性研究

       

      實驗流程

      STR位點序列的獲取→ 基因組DNA提取→ 熒光標記引物設計、合成→ 多重PCR擴增→ 毛細管電泳檢測→ Genemapper軟件分析數據

        



      服務特色:

      l ABI 3730xl遺傳分析系統,速度快,準確度高

      l 自有多種熒光探針合成,使用多熒光+內標的檢測方式,通量大、速度快,并有效保證結果準確性

      l ABI GeneMapper 4.0或Genemarker軟件自動完成數據獲取和處理分析,為后期結果分析提供可靠數據

      l 大批量樣品,可免費代為PCR擴增

       

      服務方案:

      l 跑板:客戶提供特異性擴增的PCR產物及PCR鑒定電泳圖,將PCR產物上機檢測并軟件自動讀取實驗結果,提供原始實驗結果及簡單結果分析

      l STR全套實驗服務:根據客戶實驗需求,選取合適的STR位點、設計引物,并進行預實驗以優化出的最佳實驗方案。熒光修飾引物合成,根據優化方案進行正式STR擴增和檢測實驗,將數據進行分析整理,形成最終報告提交客戶。

       

      客戶提供STR位點信息:

      STR位點上下游各250bp序列,重復單位個數相關信息

       

      STR分析所需樣品的要求:

      l DNA樣品:濃度≥20ng/ul,體積≥10ul(若位點數較多,則按1ul/位點準備),純度OD 260/280在1.7~1.9 之間。如果客戶要求提供樣品純化服務,我們將收取純化費;

      l 96孔板寄送DNA樣品時,請用硅膠墊蓋緊,并用錫紙包裹,以免樣品滲漏或者熒光衰減;

      l 血液樣品:體積大于500ul,用EDTA抗凝,送樣過程中請注意保持低溫,防止DNA降解;

      l 血斑樣品:9-25mm2大小的血斑兩個以上。對每個血樣或血斑樣本將收取DNA 提取費。若分型樣品為細胞、組織樣品,樣本要求:細胞≥105,組織≥100mg,黃豆大小;

      l 寄送樣品時,請在送樣包裹中放置足量的冰袋,以減少在運輸過程中因溫度變化導致DNA降解的可能。

       

      檢測周期

      常規檢測任務1-3周內完成,具體時間根據STR位點及樣本數而定。

       

      我們提交結果

      l Genemapper分析圖譜(PDF格式)及原始fsa格式峰型圖

      l 各峰的相對分子量等具體信息(Excel格式)

      l 完整實驗報告(包括引物序列、擴增反應體系,實驗步驟等)

      l 數據分析軟件及使用說明

       

      聯系方式

      郵箱:snp@generay.com.cn

      電話:021-67840429

       


      友情鏈接:http://www.hstbio.cn

       

        

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